Après la démission d’Hellboy, les enquêtes du BDRD continuent. Abe Sapien part en secours de Liz Sherman dans un monastère au-delà du cercle polaire et va devoir s’enfoncer très loin sous terre et pour faire une terrifiante découverte. Plus tard, c’est dans les mers du Sud infestées de requin qu’il devra affronter un esprit surpuissant.