Les 42 élèves de 3ème B du collège de Shiroiwa ont été choisis pour participer au « programme », un jeu destiné à expérimenter le meurtre; la première journée vient à peine de s’écouler que, déjà, la moitié des participants manque à l’appel. Ils ont été, pour la plupart, victimes de camarades bien décidés à participer au jeu afin de survivre. Parmi ces assassins se trouve Mitsuko Sôma, une fille à la beauté fascinante, qui dégage une véritable aura. Ses victimes furent trompées par sa beauté et sa fragilité apparente. Comment peut-elle tuer aussi facilement ? Quelqu’un sera-t-il capable de stopper sa folie meurtrière ?