Alors que la guerre est sur le point d’éclater entre l’Agence de lutte contre les cataclysmes surnaturels et le Jugondo, un conflit interne fait imploser le Jugondo. Ce coup d’état a été orchestré par Setsuna, la soeur aînée de Shizuru portée disparue pendant des années, et Mitogawa, le mystérieux garçon aux insectes. Trahie par les siens, Shizuru, qui s’est vu dépouiller de sa pierre de Sessho, se réfugie auprès de l’Agence.