L’équipage de l’Edens Zero a retrouvé Valkyrie… ou plutôt sa carcasse. Cette dernière a été lâchement tuée par la Dame Écarlate. Non seulement Homura a perdu son maître, mais elle a également appris une terrible vérité de la bouche de sa vraie mère. Shiki, révolté par la peine qu’il décèle chez son amie, décide d’aller affronter seul la Dame Écarlate…