L’histoire de « Noise » se déroule dans le futur, vraisemblablement dans le même univers que « Blame ». Le monde est alors régi par une cyberentité omnisciente, qui pourrait être un dérivé du net. L’héroïne, Susono Musubi, est une inspectrice qui enquête sur une mystérieuse affaire de disparitions d’enfants, en compagnie de son collègue Clauthor. Mais, en cours d’investigation, ils sont attaqués par un groupe se faisant appeler « The Cult ». Ces derniers utilisent un pouvoir appelé « le chaos du net » pour transformer des humains en monstres. Alors que Susono se rapproche d’une vérité aussi redoutée qu’espérée, elle est confrontée aux prémices d’une révolution gigantesque, qui pourrait bien changer la face du monde tout entier.