Sakamoto et Nakaoka périssent sous les coups des frères Yukimura. Ils n’assisteront pas à la grande modernisation que le Japon s’apprête à connaître. Shotaro et Gentaro, accompagnés du prince du royaume de Ryukyu, ont encore une mission à accomplir : tuer Rugi. Ils comptent sur Saigo Takamori pour les aider à débusquer le diabolique chef du Byakushinkyo, mais rien ne se déroule comme prévu…