Oroku Saki, plus connu sous le nom du Shredder, est revenu de l’enfer. Sera-t-il désormais un allié inattendu pour les Tortues Ninja, et plus leur ennemi juré ? Dans le quartier mutant de New York, rien ne va plus. La manifestation contre Old Hob et ses mutanimaux dégénère, mettant la paix fragile qui régnait en péril, alors que les actions d’April O’Neil contre Baxter Stockman ont là aussi des conséquences graves pour les Tortues et leurs alliés. De nouvelles alliances vont se faire et se dé…