An 195 du nouveau calendrier universel, l’organisation OZ asservit toutes les colonies du système solaire. Cinq jeunes garçons, recrutés parmi les meilleurs et surentraînés, avec à leur tête le mystérieux Heero, sont aux commandes de gigantesques robots de combat aux capacités exceptionnelles, les Gundam. Leur mission : faire de tout ce chaos un monde meilleur. Dans leur combat pour la liberté, ils sont soutenus par Relena. Face à eux, OZ envoie ses pilotes d’élite tel Zechs qui mène en secret sa propre vengeance. Pris dans un conflit qui les dépasse, découvriront-ils qui tire les ficelles dans l’ombre ?