Une fois sortis de la base secrète militaire, Kei et Kaneda se retrouvent avec Akira sur les bras. Réfugiée chez une membre de la guérilla, ils sont vite retrouvés par une émissaire de Dame Miyako. Débute alors dans un néo-Tokyo sous couvre-feu une course-poursuite entre les membres de la guérilla, les jeunes filles envoyées par Miyako et les hommes du colonel