Fujimaru est embarqué malgré lui dans le plan « Bloody Monday »,un complot terroriste orchestré dans l’ombre par le mystérieux « K ». Grâce aux conseils d’Otoya, Fujimaru parvient à démasquer Maya et réussit à la capturer. Conduite au bureau du « THIRD-i », elle est soumise àUn interrogatoire. Pendant ce temps, Fujimaru s’attèle au déchiffrement des deux fichiers que lui a remis son père et découvre une étrange similitude qui rapproche l’affaire actuelle d’une autre survenue deux ans plus tôt.